第二阶段工作时间紧、任务重、压力大，要抓重点、破难点、出亮点，周密部署、稳步推进，打好打赢排污许可清理整顿和发证登记这场攻坚战。
他要求，政治站位再提高，组织领导再强化，要清醒认识排污许可管理“全覆盖”是构建以排污许可制为核心的固定源环境管理体系的基础性工作，清理整顿和发证登记是基础的基础。
帮扶调度再深入，培训指导再细化，要进一步落实两个帮扶制度，4个片区帮扶小组要从政策、措施、手段等层面把帮扶工作往深里抓，往实里走。
难点问题再研究，对策措施再落实，对当前工作中暴露出的一些问题，要认真研究，完善对策措施。
监管联动再升级，工作合力再加强，排污许可证核发部门要及时把排污许可管理清单，整改企业清单移交环境要素管理部门和环境执法部门；环境要素管理部门要主动融入到排污许可制相关要求中来，把日常工作、涉企管理和各类专项行动与排污许可制挂上钩；环境执法部门要组织开展排污许可专项检查，要为排污许可清理整顿和发证登记工作的落实落地兜住底。
